Historia del municipio, según unos documentos del gobierno del estado de Michoacán, Epejan, y los alrededores de Panindícuaro, han estado establecidos desde la era pre hispana. Se ha estado buscando documentos y/o prueba de l existencia indígena y los orígenes. Los origines podrían ser muy complicado de probar pero información sobre existencia en el siglo XVII. En seguida hay un artículo encontrado. Periódico Oficial, Jueves 4 de Agosto del 2005. 4a. Secc. PAGINA 2 y 3.
“Panindícuaro estaba habitado desde mucho antes de la llegada de los europeos, constituido en la frontera cultural entre purépechas y chichimecas. A nivel extrarregional era dependiente de Tzintzuntzan, el centro rector de toda la cultura de Michoacán. A nivel regional dependía de Tzacapu, la cabecera fronteriza; a nivel local Panindícuaro era una unidad orgánica, tenía su centro ceremonial, gobernado por un señor principal. Además Tzantzan, Carupo, Epejan y Aguanuato, cada uno tenía su propio gobernante y tributaban a sus señores locales, a Tzacapu y a Tzintzuntzan. El asentamiento de la población era de tipo disperso, cada grupo familiar estaba asentado en su áreade trabajo. Los nativos se ocupaban de la agricultura, caza, pesca y recolección. No tenían una especialización de trabajo. La religión prehispánica fue un elemento de cohesión e impulsó la construcción de diversos templos, conocidos con los nombres de yacatas.
Los primeros propietarios en Panindícuaro fueron los Villaseñor. Juan Villaseñor fue noble español, conquistador, visitador, encomendero y vecino de la ciudad de México, quien en 1541 junto con Luis de León Romano y Juan de Alvarado fueron encomendados por el Virrey para que fundaran Valladolid, hoy Morelia. En 1570 Panindícuaro era uno de los ocho barrios que iban a adoctrinarse a Puruándiro, que era la cabecera a la cual estaba sujeta, no hay información exacta en qué año salió del valle pero para 1583 el pueblo ya estaba asentado en el lugar nombrado el «Janamo» con el nombre de San Andrés Panindícuaro. Por lo abrupto del terreno el pueblo estaba disperso, por este motivo a principios del siglo XVII las autoridades españolas por considerar no tener orden ni justicia y para controlar mejor a los naturales, optó por congregarlos, en contra de su voluntad, a Santiago Conguripo y en esta forma para los religiosos se les facilitó su evangelización. En 1633 los naturales de San Andrés Panindícuaro observaron que en Santiago Conguripo estaban descarriados y el pueblo se había dispersado; de su libre y espontanea voluntad tomaron el acuerdo de volver al lugar de origen, de donde los habían sacado, y reconstruir su poblado con Iglesia y casas de justicia, tal como lo exigían las normas españolas. En total 21 familias regresaron a refundar a San Andrés
Panindícuaro. Hombres, mujeres, niños y ancianos construyeron sus casas, además hicieron un hospital en donde tuvieron «a la Reina de los Ángeles nuestra señora y al apóstol San Andrés», santos de su devoción.
En la segunda mitad del siglo XVIII los pueblos de la región de Panindícuaro quedaron organizados en república de naturales y nombraron un Alcalde, un Regidor, un Prioste o mayordomo del hospital, un Alguacil mayor encargado de vigilar el orden y aprehender a los delincuentes, un Fiscal mayor encargado de la doctrina, misas y fiestas religiosas, y un escribano de república. Todos estaban bajo la supervisión de los viejos quienes formaban el común de los naturales, y los elegían en forma anual. Su organización política permaneció hasta el siglo XIX, en 1831 fue convertida en municipio de Panindícuaro y sus tenencias.
Para los años siguientes el pueblo evolucionó un poco, pues entre 1800 y 1850 el pueblo se componía de 4 manzanas; no fue sino hasta el año de 1970 cuando se vio un poco de progreso, se empezaron a sacar las calles rectas, pues para esa época el Pueblo se componía de callejones muy angostos.
El 28 de junio de1860, la cabecera municipal adquiere el titulo de Villa de Cajica. La época de mayor esplendor económico en el pueblo fue entre 1890 y 1910, además había crecido el Municipio en el número de habitantes, pues para ese periodo el Municipio alcanzó los 22,000 habitantes y al término de la Revolución solo contaba con 11,000 en todo el Municipio; la causa fue que muchos ricos comerciantes salieron a radicarse a Guadalajara y México donde actualmente los descendientes de estos son grandes empresarios.”
PERIODICO OFICIAL Jueves 4 de agosto del 2005. 4a. Secc. PAGINA 3
Escrito por Omar 
